Η Μαρία Λιονή γεννήθηκε στον Ορχομενό Βοιωτίας. Σπούδασε στη Νομική Σχολή του Πανεπιστημίου Αθηνών και αποφοίτησε με «άριστα».
Είναι παντρεμένη με τον καθηγητή της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου Κρήτης, Χρήστο Λιονή και μητέρα δυο παιδιών: της Ευγενίας (ερευνήτριας στη Φαρμακολογία) και του Δημήτρη (απόφοιτο του τμήματος Στατιστικής στο Οικονομικό Πανεπιστήμιο Αθηνών).
Από το 1983 ασκεί μάχιμη δικηγορία στο Ρέθυμνο και είναι δικηγόρος παρ’ Εφέταις.
Το 1986 εκλέχθηκε Δημοτική Σύμβουλος Ρεθύμνου και από το 1987 έως το 1990 διετέλεσε πρόεδρος του Δημοτικού Συμβουλίου.
Το 1994 εκλέχθηκε Νομαρχιακή Σύμβουλος Ρεθύμνου και από το 1995 έως το 1997 διετέλεσε Αναπληρώτρια Νομάρχη. Επίσης διετέλεσε Αντινομάρχης Παιδείας, Πολιτισμού και Κοινωνικής Μέριμνας.
Εκλέχθηκε εκ νέου το 2007 Δημοτική Σύμβουλος Ρεθύμνου και υπηρέτησε ως Αντιδήμαρχος αρμόδια για θέματα κοινωνικής πολιτικής.
Από το 1987 διετέλεσε μέλος της Ν.Ε. ΠΑΣΟΚ και Αναπληρώτρια Γραμματέας Περιφερειακής Επιτροπής του ΠΑΣΟΚ Κρήτης.
Από το Δεκέμβριο του 2009 έως το Δεκέμβριο 2010 διετέλεσε Γενική Γραμματέας της Περιφέρειας Κεντρικής Μακεδονίας. Από τον Ιανουάριο του 2011 πρώτη εκλεγμένη Αντιπεριφερειάρχης Κρήτης, Περιφερειακής Ενότητας Ρεθύμνης στην Αιρετή Περιφέρεια Κρήτης.
